现代的食源性肠道传染病仍然猖獗。霍乱：1991-1994年以秘鲁为主的霍乱大流行主要通过摊头食品，含水饮料及未能煮熟的海产品传播，当时全球106.2万人患病，9989人死亡。辞后每年均有霍乱暴发，主要在非洲和南亚地区。传染途径是病从口入；有专家认为，霍乱的暴发与地球上的厄尔尼诺现象可能也有关。现代霍乱病原除古典生物型O1与副霍乱埃尔托生物型弧菌外又发现了新病原霍乱弧菌O139。

　　志贺氏痢疾杆菌引发的细菌性痢疾仍占目前传染病院临床腹泻病原的52%-70%，伤寒及沙门氏菌仍旧是消化道传染病的主要病原。另外能够在冰箱条件下繁殖的李斯特菌1998年来在新西兰、法国、西欧、美国、加拿大经常有暴发和散发流行的报导，患者除消化道胃肠炎腹泻外，常以菌血症、心内膜炎和孕妇流产、关节炎、脑膜炎较多见，其中有免疫缺陷病的患者感染后死亡率高达38.2%。加拿大曾报导1998年来每年因李斯特菌导致的经济损失约1260万美元，食用冰箱中长期保存的软奶酪，污染的肉蛋和加工的酱制品，冰冻冷拌菜是致病的主要原由。

　　现代的病毒性腹泻主要病原：
　　轮状病毒感染仍居我国腹泻儿童首位；
　　诺瓦克病毒（2002年纳入诺如病毒）近年在国内外流行有上升趋势；
　　肠腺病毒偶尔引起儿童腹泻，局部地区有流行；
　　SARS、禽流感与肠道病毒感染期内都可引起腹泻，要作好病原学鉴别。

　　在肠道传染病和食物中毒的病原中，还发现了新的创伤弧菌、空肠弯曲菌、大肠埃希菌O157∶O7以及大肠杆菌O12∶K1∶H7等，还夹杂着微小隐孢子虫感染，由比氏肠胞虫引起的顽固性腹泻和卡晏环孢子球虫引起的持续性腹泻病等很多新细菌和新的寄生虫性病原。

　　在传染性腹泻患者中，还有病毒性新病原轮状病毒，1968年发现的诺瓦克病毒（2002年纳入诺如病毒），近年经常引起局部和全国性暴发流行。（至于2005年-2006年底的霍乱及胃肠道感染性疾病的疫情可参考2007年传染病信息第一期上已作了综合性报导）。古老传染性寄生虫病中还包括很多被人们忽视的穷人传染病。如血吸虫病在世界范围内又有重新抬头的势头，丝虫病，由土壤传播的蠕虫病（蛔虫病、鞭虫病、钩虫感染、蛲虫病）还有沙眼衣原体病和非洲由舌蝇传播的昏睡性锥虫病等。仍然带给新世纪很多困扰，仍应予普遍的重视和加强防治。